黄萌生于1960年，其父曾任浙江安吉县委组织部副部长。1982年，黄萌从浙江大学热物理工程系本科毕业，回安吉出任县计经委科长，从此踏上仕途。

其后，一直在计经委系统工作的黄萌一路高升，只用了5年时间便成为湖州市计委副主任，官至副处级，而当年他仅27岁。

1992年，黄萌开始独当一面。在湖州经济技术开发区管委会当了近5年的主任、党委书记后，1997年，37岁的黄萌出任湖州市副市长，官至副厅级。

2003年3月，黄萌接替黄坤明，出任湖州市市长。此时，湖州市委书记为杨仁争。

值得一提的是，黄萌担任湖州市市长不过4年，湖州却换了三任市委书记。

2004年11月，徐福宁接替杨仁争任湖州市委书记，但不到一年即落马。2006年4月，徐福宁因犯受贿罪(事起宁波任职期间)，被判处有期徒刑十年六个月。

2005年11月，时任浙江省委副秘书长、办公厅主任的孙文友接替徐福宁，出任湖州市委书记。

湖州市委书记频繁更替，在湖州广有根基的黄萌却一直未能扶正成为“一把手”。有知情人士称，黄萌自恃年轻有为，不免心高气傲，与新来的市委书记多有龃龉，在一些关键问题上甚至与一把手公开顶撞。书记与市长不和，是当年湖州官场公开的秘密。

这种“不和”只持续了一年多。2007年1月，黄萌接替身处药监风暴中的郑尚金(当年2月4日被刑拘)，出任浙江省药监局局长、党委书记。虽然级别未变，但在官场人士眼中，这显然是黄萌失势的一个象征。

2008年，湖州官场进入多事之秋。湖州市对外贸易经济合作局副局长严亚军、湖州市国土局副局长毛千宏、湖州市国有土地储备中心主任翁慧明、湖州市南浔区副区长卫国等近10名官员，因同一起受贿案被“一锅端”。这起因地产商冯荣兴行贿引发的连环案，被称作“湖州市有史以来最大的一场官场地震”。

当年，一些与黄萌关系紧密的企业家亦被调查，湖州官场一度盛传黄萌被调查的消息。

黄萌最终平稳度过了那场危机，但他未能笑到最后。

2009年5月2日凌晨，湖州市副市长倪玲妹在家蹊跷坠楼身亡。事后湖州市公安局发布事件调查结果称，“这是一起因家庭矛盾引发激烈争执，导致死者情绪失控、自行攀爬卫生间窗台坠楼身亡的事件”。湖州官场虽未有人因此受牵连，但当地民众至今对倪玲妹自杀的真相颇有猜疑。

今年春节后，湖州本地数家房地产公司老板被纪检部门约谈。5月，原湖州市国土资源管理局局长唐建章被刑拘，此时距他调任浙江省国土资源厅直属机关委员会副书记尚不足10个月。在湖州官场，唐建章向以官品好著称，此番落马，出乎许多人意料。

而随着唐建章落马，黄萌被调查的消息再度传开。或许为“自证清白”，6月21日，风口浪尖上的黄萌带下属参加浙江之声“阳光行动-厅长在线”直播节目。这已是出任省药监局长的黄萌第三次做客该节目。

6月24日，浙江省药监局举行纪念建党90周年表彰大会暨“永远跟党走”红色经典歌曲合唱大赛，黄萌出席活动并作讲话。这是目前已知的黄萌最后一次公开活动。3天后，黄萌便被纪检部门带走。

当地不同群体对黄萌落马的反应大相径庭。有人额掌相庆，亦有人扼腕叹息。

“湖州综合实力在长三角城市群中处于后进地位，要实现率先崛起，在区域竞争中赢得优势，必须完成‘蛙跳式’跨越发展。”这是黄萌任职湖州市长期间，一再对下属强调的重点。作为本地官员，黄萌对湖州颇有感情。

在不少政府工作人员眼中，黄萌的口碑不错。在药监系统，黄萌给人留下的普遍印象是“思路清晰，讲究方法”。

在一些观察人士眼中，黄在湖州任职期间的政绩亦可圈点。除大刀阔斧对经济领域进行改革外，黄萌对城市品牌的经营亦颇费心机。2006年11月，湖州市荣获“CCTV2006年度中国魅力十佳城市”，黄萌主导了整个过程，并作为湖州城市代表上台领奖。

湖州市一位与黄萌多有接触的企业家告诉时代周报记者，黄萌是一位官场不多见的个性官员，口才好、能力强、讲义气、懂经济，做事雷厉风行，知道企业的酸甜苦辣，跟企业家走得比较近，曾说过“企业家是新时代最可爱的人，政府要为企业家撑一把伞”等名言，被认为是湖州历年主要领导中最懂经济的官员之一。

“但黄的有些做派有人看不惯。比如他喜欢喝酒，喝多了后喜欢把衣服披在肩上，两个袖子搭在那里，走来走去。”这位不愿具名的人士说。对于这种做派，有人认为黄萌很率性、没有架子，有人则认为他不懂官场规矩，有些张狂。

萌究竟因何落马，是湖州市丝绸集团改制？还是来自房地产业的腐败？目前还不得而知。